当手机短信被删除后，可以尝试以下几种方法来恢复：

1. 从备份中恢复：如果之前对手机数据进行了备份，可以从备份中恢复已删除的短信。可以使用的备份工具包括手机厂商自带的备份工具、第三方备份工具，或是云服务等。

2. 使用数据恢复软件：如果没有备份，可以尝试使用数据恢复软件来扫描手机以查找已删除的短信。这些软件可以扫描手机的存储空间，并找到已经删除但未被覆盖的数据。常用的数据恢复软件包括EaseUS MobiSaver等。

3. 检查短信回收站或废纸篓：很多手机系统都有类似于回收站或废纸篓的功能，即使短信被删除，也可能在其中暂时保存一段时间。可以在相应位置查找并恢复短信。

4. 联系运营商：如果以上方法均无法恢复，还可以尝试联系手机运营商，他们可能能够帮助找回已删除的短信。但这种情况取决于运营商的政策和规定，不一定能够成功恢复。

请注意，在进行任何恢复操作之前，请确保备份手机数据以防意外损失。如果不确定如何操作或担心造成进一步损害，建议寻求专业人士的帮助。